分子力学:一种用经典力学(而非量子力学)来近似描述分子结构与能量的方法。它把原子视为“球”、化学键视为“弹簧”,用经验势能函数(力场)计算分子的构型、应变能、相互作用,并常用于构象搜索、能量最小化与大体系(如蛋白质、聚合物)建模。(在某些语境下也可泛指以力场为基础的分子建模方法。)
/məˈlɛkjələr məˈkænɪks/
We used molecular mechanics to optimize the geometry of ethanol.
我们使用分子力学来优化乙醇的几何结构。
By combining molecular mechanics with experimental restraints, the researchers refined a protein–ligand binding model and compared predicted energies across conformations.
研究人员将分子力学与实验约束结合,细化了蛋白质—配体结合模型,并比较了不同构象下的预测能量。
molecular 源自 molecule(分子),进一步可追溯到近代拉丁语 molecula(“小质量/小块”之意,来自 moles“质量、块”)。mechanics 来自希腊语 mēkhanikē(与“机械/机巧”相关的技艺),后在英语中发展为“力学”。合在一起,molecular mechanics 字面义即“用于分子层面的力学方法”,在计算化学中专指以经典力场近似分子能量与结构的理论框架。